MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013198	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013198	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013198	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013198	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013198	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013198	T	6	6	2733	2738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013198	GT	3	6	2767	2772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013198	ATC	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013198	AT	3	6	2873	2878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013198	TAGGC	2	10	2930	2939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013198	G	6	6	2999	3004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013198	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013198	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013198	TGG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013198	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013198	GAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013198	CAT	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013198	AAAT	2	8	9494	9501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013198	T	6	6	9519	9524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013198	AAC	2	6	9578	9583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013198	GTT	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013198	AAAAT	2	10	9652	9661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013198	T	6	6	9687	9692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013198	TTA	2	6	9719	9724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013198	TAT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013198	T	7	7	9748	9754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013198	GAAA	2	8	9756	9763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013198	TTA	2	6	9779	9784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013198	A	6	6	9821	9826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013198	GTA	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013198	T	6	6	10125	10130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013198	AGA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013198	A	6	6	10143	10148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013198	A	7	7	10173	10179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013198	AAT	2	6	10211	10216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013198	CTT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013198	GGT	2	6	10691	10696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013198	ATT	2	6	10748	10753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013198	TTA	2	6	11504	11509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013198	AGG	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013198	AGG	2	6	12559	12564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013198	T	7	7	12854	12860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013198	GGTA	2	8	12881	12888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013198	AT	3	6	13728	13733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013198	AT	3	6	13874	13879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013198	TA	3	6	13928	13933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013198	ATTTG	2	10	13937	13946	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013198	AGG	2	6	13967	13972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013198	ACA	2	6	16515	16520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013198	AGG	2	6	16535	16540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013198	A	6	6	16767	16772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013198	CTAA	2	8	16778	16785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013198	CA	3	6	16808	16813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013198	TAC	2	6	17128	17133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013198	GAC	2	6	17163	17168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013198	GCTA	2	8	17206	17213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013198	ATC	2	6	18280	18285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013198	ACTTG	2	10	18291	18300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013198	ACA	2	6	18385	18390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013198	TTC	2	6	18429	18434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013198	AAGA	2	8	18439	18446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013198	GTA	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013198	TGA	2	6	18474	18479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013198	ATT	2	6	18489	18494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013198	TTTA	2	8	18586	18593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013198	AAT	2	6	18611	18616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013198	ACG	2	6	18657	18662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013198	GTT	2	6	18756	18761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013198	ATG	2	6	18853	18858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013198	AGCAG	2	10	18868	18877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013198	ATG	2	6	18954	18959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013198	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013198	AAG	2	6	19058	19063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013198	T	7	7	19201	19207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013198	T	6	6	19247	19252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013198	AT	3	6	19986	19991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013198	ATAC	2	8	20016	20023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013198	ATG	2	6	20233	20238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013198	TTG	2	6	20317	20322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013198	A	6	6	20359	20364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013198	TGT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013198	GTC	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013198	TCC	2	6	21931	21936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013198	TTA	2	6	22005	22010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013198	TAT	2	6	22034	22039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013198	TAT	2	6	22082	22087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013198	TA	3	6	22091	22096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013198	ACA	2	6	22818	22823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013198	A	6	6	22884	22889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013198	CGT	2	6	22906	22911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013198	TAAT	2	8	22913	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013198	TCC	2	6	22971	22976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013198	TGCT	2	8	23000	23007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013198	TGA	2	6	23010	23015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013198	TTTA	2	8	23019	23026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013198	AAT	2	6	23044	23049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013198	TGA	2	6	23439	23444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013198	ATC	2	6	23569	23574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013198	AGC	2	6	24165	24170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013198	GGA	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013198	CTT	2	6	26869	26874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013198	GGAA	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013198	GTT	2	6	26985	26990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013198	TCT	2	6	27022	27027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013198	TCA	2	6	27042	27047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013198	AT	3	6	27066	27071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013198	GCG	2	6	27093	27098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013198	ACA	2	6	27120	27125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013198	AAC	2	6	27149	27154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013198	AAT	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013198	CTG	2	6	27197	27202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013198	GGGC	2	8	27216	27223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013198	CAA	2	6	27232	27237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013198	TGCG	2	8	27257	27264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013198	TGT	2	6	27302	27307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013198	CAA	2	6	27309	27314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013198	TTG	2	6	27434	27439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013198	TTTG	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013198	GGC	2	6	27528	27533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013198	AGG	2	6	29800	29805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013198	A	6	6	29876	29881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013198	GTT	2	6	29911	29916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013198	GGGT	2	8	29988	29995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013198	TTAA	3	12	31266	31277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013198	GTT	2	6	31332	31337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013198	A	6	6	31411	31416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013198	CCT	2	6	34744	34749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013198	GTT	2	6	34798	34803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013198	TAA	2	6	34808	34813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013198	TGT	2	6	34862	34867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013198	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013198	ATG	2	6	36700	36705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013198	CGC	2	6	36750	36755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013198	GCG	2	6	36776	36781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013198	TTGC	2	8	36785	36792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013198	TGC	2	6	37606	37611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013198	TCA	2	6	37708	37713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013198	AAG	2	6	37754	37759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013198	ACG	2	6	38373	38378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013198	AT	3	6	38390	38395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013198	TGA	2	6	38428	38433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013198	ATC	2	6	38447	38452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013198	T	6	6	38463	38468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013198	CAA	2	6	39626	39631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013198	GAT	2	6	39634	39639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013198	TAA	2	6	39660	39665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013198	AG	3	6	39672	39677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013198	T	6	6	39724	39729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013198	AC	3	6	41295	41300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013198	A	6	6	41305	41310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013198	TCA	2	6	41339	41344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013198	TCT	2	6	41400	41405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013198	CGA	2	6	42086	42091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_013198	GTTT	2	8	42292	42299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013198	AAG	2	6	42330	42335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013198	TA	3	6	42357	42362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_013198	TGT	2	6	43089	43094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013198	AAGT	2	8	43100	43107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013198	TGT	2	6	43193	43198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_013198	TGA	2	6	43335	43340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013198	AAC	2	6	43389	43394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_013198	AAGGA	2	10	43501	43510	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013198	TA	3	6	43529	43534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013198	TGGG	2	8	43559	43566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013198	ATT	2	6	43577	43582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_013198	TA	3	6	44000	44005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013198	T	6	6	44045	44050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_013198	TCTA	2	8	44096	44103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_013198	A	9	9	44337	44345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013198	TCG	2	6	44359	44364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_013198	TATT	2	8	44470	44477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013198	GAA	2	6	44604	44609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_013198	ATTT	2	8	45059	45066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013198	T	6	6	46070	46075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_013198	A	7	7	46111	46117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_013198	CAA	2	6	46124	46129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_013198	TGAT	2	8	82860	82867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_013198	GAC	2	6	83022	83027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_013198	TCC	2	6	86557	86562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_013198	T	7	7	130495	130501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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